Dana 16. veljače 2016. američki savezni sudac naredio je Appleu da pomogne FBI-u hakirati iPhone u vlasništvu Syeda Farooka, jednog od napadača u Napadi u prosincu 2015 u San Bernardinu.

FBI je zatražio od Applea da stvori verziju iOS-a koja bi onemogućila sigurnosne značajke zaporke i omogućila elektronički unos zaporki, dopuštajući mu da zatim grubo forsira šifru na uređaju.

Apple je najavio da će se usprotiviti nalogu u otvorenom pismu Tim Cooka, koji je rekao da će zahtjev FBI-a postaviti 'opasan presedan' s ozbiljnim implikacijama na budućnost enkripcije pametnih telefona. Apple je rekao da bi softver koji je FBI tražio mogao poslužiti kao 'glavni ključ' koji se može koristiti za dobivanje informacija s bilo kojeg iPhonea ili iPada - uključujući njegove najnovije uređaje - dok je FBI tvrdio da želi pristup samo jednom iPhoneu.

Appleov spor s FBI-em okončan je 28. ožujka 2016. nakon što je vlada pronašla alternativni način pristupa podacima na iPhoneu uz pomoć izraelske tvrtke Cellebrite i povukla tužbu.